Υπολογισμός Υπολογιστικής Κβαντικής Μηχανικής: 4 Βήματα

2024 Συγγραφέας: John Day | [email protected]. Τελευταία τροποποίηση: 2024-01-30 08:34

Οι υπολογιστικοί υπολογισμοί στη χημεία και τη φυσική μπορούν να αποκαλύψουν πολύ ενδιαφέρουσες ιδιότητες σε ορισμένα δείγματα (ειδικά εάν υπόκεινται σε τροποποιήσεις για καλύτερη απόδοση μιας δεδομένης αρχικής ένωσης). στις διαδικασίες, εκτός από παράγοντες διπολικής ροπής, αστάθεια, ηλεκτροστατικό χάρτη δυναμικού, ενεργειακό διάγραμμα και υπολογισμούς πιθανότητας αντιδραστικότητας, όπου η χρήση υπολογιστικών κβαντικών υπολογισμών συντομεύει τον εργαστηριακό χρόνο, καθιστώντας σαφές και συγκεκριμένο εάν η σύνθεση μιας πιθανής ένωσης είναι βιώσιμη. οικονομικά και χρονικά λέγοντας.

Προμήθειες

• Ποσοστό
• Μοντελοποίηση μορίων.
• Μοριακά τροχιακά Orca Avogadro

Βήμα 1: Υπολογισμός υπολογισμού κβαντικής μηχανικής - Avogadro

Ως πρώτο βήμα, κατεβάστε το Avogadro που έχει τη δυνατότητα εισαγωγής με το λογισμικό Orca

Στο λογισμικό Avogadro, έχετε εγγύηση ότι θα δημιουργήσετε τα μόριά σας και θα τα βελτιστοποιήσετε κατά 99,9%. για την αποφυγή συγκρούσεων με την εντολή Ctrl + Alt + o, η οποία με τη σειρά της δεν εγγυάται τη σωστή μοριακή συμπίεση κατά τη χρήση επεκτάσεων εισόδου για το Orca.

Για να βελτιστοποιήσετε το μόριο, δημιουργήστε πρώτα το μόριο που σας ενδιαφέρει (προφανώς) και, στη συνέχεια, κάντε κλικ στο Ε (σημειώστε ότι κάτω από αυτό το Ε υπάρχει ένα κάτω βέλος), οπότε ένας παρόμοιος υπολογισμός θα εμφανιστεί στην επάνω αριστερή γωνία της οθόνης που περιέχει το λογισμικό Το

Βήμα 2: Το λογισμικό Orca

Με αυτήν την είσοδο σωστά, κάντε κλικ στην καρτέλα επεκτάσεις, εξακολουθώντας να αναφέρεται στο λογισμικό Avogadro και αναζητήστε την επιλογή ORCA

Κάντε κλικ στο Advanced, όταν ανοίξει η οθόνη για τη δημιουργία της εισόδου, και στο Date σημειώστε την επιλογή MO και τη δεύτερη παρακάτω. - ΑΦΗΣΤΕ ΔΥΟ ΣΗΜΕΙΑ - για να λάβετε πυκνότητα ηλεκτρονίων και ενεργοποιημένα μοριακά τροχιακά κατά τη διάρκεια κβαντικών υπολογισμών που θα εκτελέσει η Orca - μόνο διαδικασίες εισαγωγής.)

Μετά από μια τέτοια διαδικασία στην καρτέλα Basic, ολοκληρώστε μετά την εντολή:! RHF SP def2-SVP

εισαγάγετε τον κωδικό σωστά / προσεκτικά…

! Κανονική εκτύπωση

% εξόδου

Εκτύπωση [P_Basis] 2

Εκτύπωση [P_MOs] 1

τέλος

ΛΕΠΤΟΜΕΡΕΙΕΣ, πριν πραγματοποιήσετε μια τέτοια λειτουργία, κατεβάστε και εγκαταστήστε το Orca στον υπολογιστή σας!

Αφού εκτελέσετε τις παραπάνω εντολές, κάντε κλικ στην επιλογή Δημιουργία και αποθηκεύστε ένα τέτοιο αρχείο. Εισαγάγετε το φάκελο στον οποίο είναι εγκατεστημένο το Orca. (Παράδειγμα: Εγκατέστησα το Orca στη μονάδα C του υπολογιστή μου -> αποθηκεύστε το αρχείο στη μονάδα C του υπολογιστή σας μέσα στο φάκελο Orca).

Βήμα 3: Στο Cmd Run…

Ανοίξτε το cmd και πληκτρολογήστε:

cd C: / Orca; Το λογισμικό Orca είναι εγκατεστημένο στη μονάδα C του υπολογιστή σας… και πατήστε enter.

Θα λάβετε μια οθόνη παρόμοια με την εικόνα αυτού του τμήματος, μετά από μια τέτοια διαδικασία, παρατηρήστε εάν η εντολή είναι σωστή με το σενάριο C: / Orca> Εάν αυτή η εντολή είναι σωστή, πληκτρολογήστε μπροστά από το σύμβολο συν (>) της εντολής:

orca.exe (το όνομα του μορίου που αποθηκεύσατε στο φάκελο Orca).inp> (το όνομα του μορίου που αποθηκεύσατε στο φάκελο Orca).out

ΛΕΠΤΟΜΕΡΕΙΕΣ - ΔΕΝ ΥΠΑΡΧΟΥΝ ΣΥΓΓΕΝΕΙΣ ΣΤΗΝ ΕΝΤΟΛΗ ΚΑΙ ΜΟΝΟ ΤΟ ΟΝΟΜΑ ΤΗΣ ΜΟΡΙΑΣ ΣΑΣ

Μετά από αυτό, πατήστε enter και περιμένετε … Στην περίπτωσή μου έχασα την εντολή αρκετές φορές επειδή η πολλαπλότητα είναι μια περιττή τιμή και ο αριθμός των ηλεκτρονίων μου είναι επίσης περιττός, αν συμβεί αυτό αλλάξτε την τιμή πολλαπλότητας σε 2 στο προηγούμενο βήμα στο Basic (σε Λογισμικό Avogadro).

Βήμα 4: Περιμένετε ένα λεπτό…

Αφού δοθεί η εντολή, αναζητήστε μια υπογράμμιση στην επόμενη γραμμή εντολών του cmd

αν υπάρχει, WONDER, συνεχίζοντας … Περιμένετε λίγο μέχρι να εμφανιστεί ο όρος σεναρίου:

cd: / Orca_

Για να βεβαιωθείτε ότι το αρχείο.out δημιουργήθηκε μέσα στο φάκελο εγκατάστασης Orca, εκείνο όπου αποθηκεύτηκε το αρχείο εισόδου που δημιουργήθηκε στο Avogadro.

Αφού γίνει ο υπολογισμός μέσω cmd στο Orca, αναζητήστε το αρχείο.out στο φάκελο Orca. Αυτή τη στιγμή μπορείτε να κλείσετε το μόριο σας (Avogadro) και cmd, στο τέλος ο κβαντικός υπολογισμός έχει ήδη γίνει…

Στο επόμενο βήμα, ανοίξτε ξανά το Avogadro και στην ανοιχτή καρτέλα, αναζητήστε το δημιουργημένο αρχείο.out και ανοίξτε το. θα δείτε ότι θα υπάρχει το μόριό σας δίπλα στις τιμές HOMO και LUMO Orbital, σύρετε λίγο την καρτέλα προς τα κάτω και θα δείτε ότι υπάρχουν υπολογισμοί για τροχιακά που θα δώσουν περίπου 100% βελτιστοποίηση, όπως αποκαλύπτει η εικόνα.

… Και διασκεδάστε…